Windows上で、特定のファイルを参照できる機能を持ったファイルやフォルダ、又は、アイコンそのものを指して言います。通常、PCの深い階層にあるファイルを開きたい場合は、そこまで到達して開かなければなりませんが、デスクトップ上にショートカットを作成しておくことによって、それをクリックするだけで、そのファイルを開くことができます。このように、アクセスを容易にする為に使用されることがほとんどです。目的のファイルを開く為の入り口を増やすだけですので、複数作成したり、削除したりしても本体に影響を与えることはありません。
ショートカットの作成方法は、作成したいファイルの上にカーソルを当て、右クリックをします。すると、

のような画面が出てきますので、【ショートカットの作成】を選択すれば出来上がります。これを、デスクトップや階層の浅いフォルダに置いておけばすぐにアクセスが可能になります。

MacOSではエイリアス、UNIX系OSでは、シンボリックリンクと同等の機能があり、同義語として使われることが多いのですが、決して同じものではありません。エイリアスは、本体が移動したり、ファイル名が変わったりしても、リンク切れすることがないのに対し、ショートカットやシンボリックリンクの場合はリンク切れを起こします。当然のことながら、本体を削除するとリンクは切れてしまいます。
